RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 MT-ND4LP03901 98 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 LEPP41159 167 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GUCA2BQ16661 112 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 BAGE2Q86Y30 109 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 Q8N1X5 172 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 DCANP1Q8TF63 244 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TVP23CQ96ET8 276 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00052Q96N35 136 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SOCS3O14543 225 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ATP5G3P48201 142 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF138P52744 262 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP10-3P60369 221 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 RHEBQ15382 184 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 DUX3Q96PT4 197 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 LTAP01374 205 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 RNF151Q2KHN1 245 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 PSMG4Q5JS54 123 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 STHQ8IWL8 128 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 PARLQ9H300 379 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 PSG8Q9UQ74 426 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 A0A087WWC5 75 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CXorf65A6NEN9 183 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SLC17A3O00476 420 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 APOC3P02656 99 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF688P0C7X2 276 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 HLA-DRB4P13762 266 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 TFPI2P48307 235 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 CENPWQ5EE01 88 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf77Q96MU5 243 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF492Q9P255 531 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.47□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0J9YX75 114 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 FAM231BA6NCW3 169 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 M0R036 132 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 CRISP2P16562 243 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 S100PP25815 95 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 TIRAPP58753 221 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 DEFB131AP59861 70 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 Q6AWC8 147 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.46□□□□□ -1.54
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SMAD4-210ENST00000590061 Q86TA4 180 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 KCNS1Q96KK3 526 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 PRR25Q96S07 402 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 IMMP2LQ96T52 175 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.46□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 VWFP04275 2813 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 A8MWL6 223 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 H3BTX0 84 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 M0R3E3 92 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 GCGP01275 180 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 P01737 135 aa5.45□□□□□ -1.54
SMAD4-210ENST00000590061 GPX1P07203 203 aa5.45□□□□□ -1.54
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