RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	MZT2A	Q6P582	158 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR82	Q96P67	336 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	ENY2	Q9NPA8	101 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	DIABLO	Q9NR28	239 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WX48	190 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	OR4E1	P0C645	316 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ORM2	P19652	201 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	BEST4	Q8NFU0	473 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A1W2PNN7	141 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC160	A6NGH7	325 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CRP	P02741	224 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS2R20	P59543	309 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ELOB	Q15370	118 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	PGP	A6NDG6	321 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	HPGDS	O60760	199 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF253	O75346	499 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	GNG2	P59768	71 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617		A6NHS1	94 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CTDSP2	O14595	271 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	NMS	Q5H8A3	153 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	MCFD2	Q8NI22	146 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	TRGV9	Q99603	122 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS3	P35030	304 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	HERV-K104	P61576	105 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	HOGA1	Q86XE5	327 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	C15orf56	Q8N910	161 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SPX	Q9BT56	116 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	BATF3	Q9NR55	127 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WWC5	75 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	C5orf51	A6NDU8	294 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM25A	B3EWG3	89 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM25C	B3EWG5	89 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM25G	B3EWG6	89 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR31	O00270	319 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	RGS5	O15539	181 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	MIA	Q16674	131 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	GPX8	Q8TED1	209 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SOST	Q9BQB4	213 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ABCD4-222	ENST00000555617	CTDSPL	O15194	276 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	CRISP2	P16562	243 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A087WWL8	130 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	GABARAP	H6UMI1	98 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617		M0R2P5	195 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	GPX1	P07203	203 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A5	P33763	92 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	AMT	P48728	403 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SPCS3	P61009	180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	BAK1	Q16611	211 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF876P	Q49A33	203 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ABCD4-222	ENST00000555617	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.26	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms