RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347077.8

ZNF546-201, Transcript of zinc finger protein 546, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF546, Length 7,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546-201ENST00000347077 INSL3P51460 131 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 C1orf159Q96HA4 380 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GFI1Q99684 422 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE12JA6NER3 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE7O76087 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE12FP0CL80 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE12GP0CL81 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE12IP0CL82 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE4Q13068 117 aa4.85□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 CELA3BP08861 270 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 IGLC2P0DOY2 106 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 IGLC3P0DOY3 106 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 MPV17L2Q567V2 206 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 HIVEP2P31629 2446 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 K7EP13 123 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 H7C423 109 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 K7EMT4 169 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 SAA4P35542 130 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 CD177Q8N6Q3 437 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ZNF546-201ENST00000347077 NDUFC1O43677 76 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGLV3-1P01715 115 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV2-5P01817 119 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MST1LQ2TV78 715 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 ODF3Q96PU9 254 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.84□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 H3BTX0 84 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 J3QQQ9 107 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV3-48P01763 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 Q6ZSR3 168 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 DEPPQ9NTK1 212 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 GPHA2Q96T91 129 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 V9GYY9 64 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 F6UB75 175 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LTBRP36941 435 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LINC01620Q4KN68 170 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 CARD19Q96LW7 228 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 K7ENP7 123 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 FGF6P10767 208 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE5Q13069 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE6Q13070 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LTBP2Q14767 1821 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LTAP01374 205 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 CELA3AP09093 270 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 C16orf74Q96GX8 76 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 V9GYV3 84 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 H3BMG7 143 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 VOPP1Q96AW1 172 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV3-11P01762 117 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 PIFOQ8TCI5 191 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 A0A0G2JNJ9 132 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 Q9UFV3 132 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 TIMM17AQ99595 171 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 A0A087X0K7 114 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 hADV29S1A0JD25 119 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 LINC00473A8K010 186 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 A0A0J9YXY3 114 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 UBE2BP63146 152 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 NPBQ8NG41 125 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 ADAMTS20P59510 1910 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 A6NNC1 897 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 COL4A5P29400 1685 aa4.81□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 HTN3P15516 51 aa4.81□□□□□ -1.64
ZNF546-201ENST00000347077 VWCEQ96DN2 955 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms