RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPINK13Q1W4C9 94 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISOC2Q96AB3 205 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBA4BQ9H853 241 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R2Z0 102 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM162BQ5T6X4 162 aa20.22■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.22■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4DEV8 164 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 FXYD7P58549 80 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVFC1-1P60608 527 aa20.21■□□□□ 0.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf54Q8N8G6 183 aa20.2■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 CMYA5Q8N3K9 4069 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLLNB2CW77 178 aa20.19■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMBPP02760 352 aa20.19■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2D1AO60880 128 aa20.17■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR9Q5T870 116 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10G8Q8NGN5 311 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRIP1P50238 77 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR3DS1Q14943 382 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf77A4D0Y5 90 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R2P9O14990 202 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 GFI1BQ5VTD9 330 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM231DQ6ZW35 169 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS10P5Q9NQ39 176 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF212Q495C1 297 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6AWC8 147 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT10Q8NFP7 164 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT11Q96G61 164 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 INSP01308 110 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTL1Q9H114 145 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ORM1P02763 201 aa20.12■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTDSP1Q9GZU7 261 aa20.11■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C20orf144Q9BQM9 153 aa20.09■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WWC5 75 aa20.08■□□□□ 0.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM208Q9BTX3 173 aa20.07■□□□□ 0.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 V9GYV3 84 aa20.07■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MZ25 164 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNS1Q96KK3 526 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC01587Q99440 93 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa20.05■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CT83Q5H943 113 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM256Q8N2U0 113 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM242Q9NWH2 141 aa20.04■□□□□ 0.8
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