RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RRN3P1Q2M238 152 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 TVP23CQ96ET8 276 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2P10415 239 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1C3P42330 323 aa16.11■□□□□ 0.17
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HOXD4-201ENST00000306324 PMS2P11Q13670 270 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R60P59551 318 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXD4-201ENST00000306324 Q86TA4 180 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.1■□□□□ 0.17
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HOXD4-201ENST00000306324 C11orf52Q96A22 123 aa16.04■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 CBY3A6NI87 242 aa16.03■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 C11orf45Q8TAV5 145 aa16.03■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.03■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 TOR2AQ5JU69 321 aa16.03■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.01■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.01■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 BAGE2Q86Y30 109 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM210AQ96ND0 272 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPART-AS1P0CW21 52 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 DKK2Q9UBU2 259 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 SNURFLB1AK76 121 aa15.98■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.97■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 CENPWQ5EE01 88 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.97■□□□□ 0.15
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HOXD4-201ENST00000306324 CEBPGP53567 150 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TDRG1Q3Y452 100 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 KCNS1Q96KK3 526 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 LYRM9A8MSI8 78 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 CRIP1P50238 77 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.95■□□□□ 0.14
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