RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RRN3P1Q2M238 152 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 TVP23CQ96ET8 276 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 BCL2P10415 239 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 AKR1C3P42330 323 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2G1P62253 170 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 PMS2P11Q13670 270 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 EMP1P54849 157 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R60P59551 318 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 Q86TA4 180 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 FMC1Q96HJ9 113 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 C8orf49Q96NF6 230 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 Q6ZQT7 251 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 VAX2Q9UIW0 290 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXD4-201ENST00000306324 AZU1P20160 251 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 RGS13O14921 159 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 SMUG1Q53HV7 270 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 Q6AWC8 147 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM189A5PLL7 270 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 PDE6DO43924 150 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 GCGP01275 180 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 RBFOX3A6NFN3 312 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 MUC21Q5SSG8 566 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 IL17DQ8TAD2 202 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf52Q96A22 123 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf74Q96GX8 76 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 CBY3A6NI87 242 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf45Q8TAV5 145 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 NAGKQ9UJ70 344 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 LTAP01374 205 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 TOR2AQ5JU69 321 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 DERL1Q9BUN8 251 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 MED9Q9NWA0 146 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 CELA1Q9UNI1 258 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD4-201ENST00000306324 RPL35P42766 123 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf65A6NEN9 183 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF506Q5JVG8 444 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 NHLRC2Q8NBF2 726 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 MUC7Q8TAX7 377 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 PFN1P07737 140 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM222AQ5U5X8 452 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 BAGE2Q86Y30 109 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM210AQ96ND0 272 aa16■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPART-AS1P0CW21 52 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 DKK2Q9UBU2 259 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 SNURFLB1AK76 121 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 RAB14P61106 215 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF767PQ75MW2 155 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 RAB19A4D1S5 217 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 IFITM2Q01629 132 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 CENPWQ5EE01 88 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD4-201ENST00000306324 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 CEBPGP53567 150 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 TDRG1Q3Y452 100 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 KCNS1Q96KK3 526 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 LYRM9A8MSI8 78 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 CRIP1P50238 77 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD4-201ENST00000306324 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms