RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 RANP62826 216 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 IQCJQ1A5X6 159 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 KHDC3LQ587J8 217 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 MORN5Q5VZ52 161 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 LCN15Q6UWW0 184 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 A0A087WWC5 75 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 IFITM10A6NMD0 228 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TAS2R45P59539 299 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 DEFB131AP59861 70 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PDE6HQ13956 83 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 C20orf202A1L168 122 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PHOX2AO14813 284 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 NPSP0C0P6 89 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZNF688P0C7X2 276 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 CASC10Q5T4H9 136 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 C16orf92Q96LL3 132 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 HERC2O95714 4834 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PPV4 95 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SEC11BP0C7V7 166 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PSMG4Q5JS54 123 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SMIM12Q96EX1 92 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RPRMQ9NS64 109 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 UMAD1C9J7I0 102 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 H3BQ15 152 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 STAG3L2P0CL84 134 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 STAG3L3P0CL85 134 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DRB4P13762 266 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 FABP4P15090 132 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 APOC4P55056 127 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PSG9Q00887 426 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 FXYD5Q96DB9 178 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZNF503Q96F45 646 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 YPEL4Q96NS1 127 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ATG101Q9BSB4 218 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 PAXXQ9BUH6 204 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RETNQ9HD89 108 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 RFNGQ9Y644 331 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-209ENST00000580646 A8MTW9 85 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 B4DEV8 164 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 OR7C2O60412 319 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PYYP10082 97 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 GZMBP10144 247 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 SULT1A2P50226 295 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 PSG3Q16557 428 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 STHQ8IWL8 128 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-209ENST00000580646 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.27□□□□□ -1.25
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