RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	OVOL1	O14753	267 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	CXCL1	P09341	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	DCANP1	Q8TF63	244 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	PRR25	Q96S07	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736		P01737	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	F8	P00451	2351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	CT83	Q5H943	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF138	P52744	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	ERCC8	Q13216	396 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736		Q8TAT8	98 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	CSN3	P07498	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736		K7EQG2	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	C8orf49	Q96NF6	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEG3-227	ENST00000556736	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736		A8MWL6	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TYMS	P04818	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	ASCL2	Q99929	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TFPI2	P48307	235 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	CRIP1	P50238	77 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	RAB5B	P61020	215 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	FAM231B	A6NCW3	169 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	SH2D1A	O60880	128 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TCL1A	P56279	114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	PSMG4	Q5JS54	123 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	NEU1	Q99519	415 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-227	ENST00000556736	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	HIGD1C	A8MV81	97 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	COX19	Q49B96	90 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	OR4C46	A6NHA9	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736		F6UB75	175 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23

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