RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ENY2Q9NPA8 101 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 F5P12259 2224 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTORP42345 2549 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 CUBNO60494 3623 aa-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1W2PPB8 328 aa-1.27□□□□□ -2.61
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RNU6-397P-201ENST00000516226 FMN1Q68DA7 1419 aa-1.27□□□□□ -2.61
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RNU6-397P-201ENST00000516226 PKD1P98161 4303 aa-1.27□□□□□ -2.61
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RNU6-397P-201ENST00000516226 CNIH1O95406 144 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 H3F3AP84243 136 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM9CQ8IZT9 166 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 BORCS7Q96B45 105 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 BPESC1Q9GZL8 116 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITPR1Q14643 2758 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPAG17Q6Q759 2223 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 DEXIO95424 95 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 CALB1P05937 261 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 IDO1P14902 403 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 CSAG1Q6PB30 78 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 C8orf76Q96K31 380 aa-1.29□□□□□ -2.62
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RNU6-397P-201ENST00000516226 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 CEP164Q9UPV0 1460 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A0A6YYH2 397 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 A6NJ64 397 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHBP35232 272 aa-1.3□□□□□ -2.62
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RNU6-397P-201ENST00000516226 IMPG1Q17R60 797 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q5VSD8 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00269Q8N2A0 174 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 USE1Q9NZ43 259 aa-1.3□□□□□ -2.62
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RNU6-397P-201ENST00000516226 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGF2P01344 180 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFNA4P05014 189 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 OMPP47874 163 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 VPS29Q9UBQ0 182 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 LAMC1P11047 1609 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 C9JAW5 83 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 RER1O15258 196 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERPINA6P08185 405 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM151BQ6UXP7 276 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTH2Q96A98 100 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 RREB1Q92766 1687 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 BBIP1A8MTZ0 92 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE6DO43924 150 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
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