RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C5orf67F2Z3F1 127 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00483Q53H64 154 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPRSQ13332 1948 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SNCAP37840 140 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q96M85 177 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PTPRBP23467 1997 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ALPK3Q96L96 1907 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RBAKDNA6NC62 111 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NDUFB6O95139 128 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BET1LQ9NYM9 111 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 S4R3C0 116 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNMBPQ6XZF7 1577 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AGRNO00468 2067 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A0A0J9YX75 114 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LPAL2Q16609 132 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MUCL1Q96DR8 90 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-1334P-201ENST00000516032 E7EQL1 145 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PIRTP0C851 137 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 INSL4Q14641 139 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TSKUQ8WUA8 353 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCN1AP35498 2009 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COX7CP15954 63 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF345Q14585 488 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C12orf73Q69YU5 71 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CITO14578 2027 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LCTP09848 1927 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 USP54Q70EL1 1684 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HMSDA8MTL9 139 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GNGT2O14610 69 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PROSCO94903 275 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q0VG73 95 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PEA15Q15121 130 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CASC2Q6XLA1 102 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARPINQ7Z6K5 226 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q8N8P6 123 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DPH3P1Q9H4G8 78 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYH1P12882 1939 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARID1AO14497 2285 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 H3BQ15 152 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPRNQ5BIV9 151 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCN4AP35499 1836 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLXNA3P51805 1871 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SSSCA1O60232 199 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBL3O95164 117 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms