RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 J3QLI3 93 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD3EP07766 207 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PMVKQ15126 192 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 MDP1Q86V88 176 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX3Q96PT4 197 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 S1PR3Q99500 378 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 EDN2P20800 178 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 AAED1Q7RTV5 226 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 WNT9BO14905 357 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF883P0CG24 379 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 METRNQ9UJH8 293 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PI4KAP42356 2102 aa5.38□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC01559Q495D7 138 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2orf83Q53S99 150 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPH3Q96FX2 82 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF185Q96GF1 192 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 GP9P14770 177 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRCDQ00LT1 54 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDK2Q58EX2 2172 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF815PA8K554 130 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 OVOL1O14753 267 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DTX2Q86UW9 622 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.37□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3BMM0 161 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPINT2O43291 252 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBE2WQ96B02 151 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2orf48Q96LS8 159 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 A8MZ25 164 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLNP26678 52 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEFB103AP81534 67 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 C8orf49Q96NF6 230 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFAND5O76080 213 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 COX6B1P14854 86 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLGLB1Q02325 96 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC01620Q4KN68 170 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q6ZS46 218 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q8N8P6 123 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LEAP2Q969E1 77 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.36□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCNX2A6NKB5 2137 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1W2PRX2 142 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 hADV29S1A0JD25 119 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A16P16260 332 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DSCR8Q96T75 97 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 E7EUB6 86 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ORM1P02763 201 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYGDP07320 174 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRPP07492 148 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q8IYB0 196 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LINC01600Q96MT4 127 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGHV3-30P01768 117 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGHV4-39P01824 125 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRYGAP11844 174 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 LIFP15018 202 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLA-DMBP28068 263 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 GNG12Q9UBI6 72 aa5.35□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.34□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 F8VRH5 84 aa5.34□□□□□ -1.55
CACNA2D3-210ENST00000490478 H7C2G1 150 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms