RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.66□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OVOL3O00110 214 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SCRG1O75711 98 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OR2H2O95918 312 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 NGFP01138 241 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 P0DMU3 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FAM231AP0DMU4 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FAM231CP0DMU5 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PRCDQ00LT1 54 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 EDDM3AQ14507 147 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 THAP8Q8NA92 274 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 FXYD5Q96DB9 178 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 SGK494Q96LW2 274 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 LINC01587Q99440 93 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PKP4-211ENST00000481115 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PGPA6NDG6 321 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 VCYO14598 125 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 SPINT2O43291 252 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 COX7A2P2O60397 106 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FCGR3BO75015 233 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM4O75871 244 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ZFAND5O76080 213 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TCRAP04437 139 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CA6P23280 308 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C3AR1Q16581 482 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 S1PR3Q99500 378 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 OTORQ9NRC9 128 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FZR1Q9UM11 496 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 USF3Q68DE3 2245 aa5.64□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 LINC00473A8K010 186 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C12orf77C9JDV5 145 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 K7ERJ3 54 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PRRG2O14669 202 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 NDUFA7O95182 113 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DMBP28068 263 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CXCL5P42830 114 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FOXF2Q12947 444 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TMEM101Q96IK0 257 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PROCRQ9UNN8 238 aa5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 MED13Q9UHV7 2174 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C9JAW5 83 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 NPFFO15130 113 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 FSTL3O95633 263 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A16P16260 332 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 Q86TA4 180 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 BAALCQ8WXS3 180 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 IGF2RP11717 2491 aa5.62□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 C16orf97H3BN30 126 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 H3BT86 120 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 AGRNO00468 2067 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 HSPB6O14558 160 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A20O43772 301 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 SCGB2A1O75556 95 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CRYGDP07320 174 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CD7P09564 240 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 CRYGAP11844 174 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PSMB2P49721 201 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 ZNF138P52744 262 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 DLX6P56179 175 aa5.61□□□□□ -1.51
PKP4-211ENST00000481115 PLGLAQ15195 96 aa5.61□□□□□ -1.51
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