RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 QRFPP83859 136 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A2Q01362 244 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 FLOT2Q14254 428 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 MSMO1Q15800 293 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf100Q5SVJ3 147 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IDNKQ5T6J7 187 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51H1Q8NH63 302 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL28Q9NRJ3 127 aa2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A075B6Q4 140 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 GGTLC3B5MD39 225 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HSMCR30P0CW71 290 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RD3LP0DJH9 198 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10J1P30954 320 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 G6PCP35575 357 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPA13P48723 471 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CXCL6P80162 114 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 AADACL3Q5VUY0 350 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF738Q8NE65 137 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 GTSF1Q8WW33 167 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.45□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SPINK4O60575 86 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CHTF8P0CG12 524 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYGAP11844 174 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A4P12235 298 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 GADD45AP24522 165 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CBX5P45973 191 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL5P46777 297 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 GALR1P47211 349 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RND2P52198 227 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10A3P58181 314 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 Q1RN00 199 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 HACD4Q5VWC8 232 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 Q8TAT8 98 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IL22RA2Q969J5 263 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.44□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG12O94817 140 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC11BP0C7V7 166 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMS3P0CW19 117 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 LIMS4P0CW20 117 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 PGAM2P15259 253 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 DTYMKP23919 212 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 F2RP25116 425 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 LEPP41159 167 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 LPAR6P43657 344 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CCR6P51684 374 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 TCL1AP56279 114 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SPINK9Q5DT21 86 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CNIH2Q6PI25 160 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 IQCF2Q8IXL9 164 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF182Q8N6D2 247 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35G3Q8N808 338 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF555Q8NEP9 628 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR1L4Q8NGR5 311 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5H2Q8NGV7 314 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 BORCS5Q969J3 196 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf50Q96LR7 162 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 CIB1Q99828 191 aa2.43□□□□□ -2.02
ECHDC1-211ENST00000460558 RSG1Q9BU20 258 aa2.43□□□□□ -2.02
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