RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BQ15 152 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLC2P0DOY2 106 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NPPCP23582 126 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE6HQ13956 83 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GPHB5Q86YW7 130 aa18.03■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF727A8MUV8 499 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 BUB3O43684 328 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN12Q6JVE5 192 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GTSCR1Q86UQ5 136 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TVP23CQ96ET8 276 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL26Q96S19 204 aa18.02■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 B4DEV8 164 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GGTLC3B5MD39 225 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP5D1E7EU14 171 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EMT4 169 aa18.01■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa18.01■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV19A0A075B6N1 114 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF253O75346 499 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RHEBQ15382 184 aa18■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM7Q9BQ49 75 aa18■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF586Q9NXT0 402 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT8Q9UHE5 227 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF785A8K8V0 405 aa17.99■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 IL17DQ8TAD2 202 aa17.99■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRAIDQ6UW56 229 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8I2Q8N0Y5 310 aa17.98■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 OTORQ9NRC9 128 aa17.98■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087X0K7 114 aa17.96■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB125Q8N687 156 aa17.96■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR2K2Q8NGT1 345 aa17.96■□□□□ 0.47
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CAPNS1-216ENST00000628306 SCO2A0A1W2PP80 73 aa17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PS18 150 aa17.95■□□□□ 0.46
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CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf77A4D0Y5 90 aa17.94■□□□□ 0.46
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CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf54Q6UWD8 224 aa17.93■□□□□ 0.46
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CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf24Q9BUV8 137 aa17.92■□□□□ 0.46
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CAPNS1-216ENST00000628306 BMI1P35226 326 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CNN1P51911 297 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 GLMPQ8WWB7 406 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM12Q96EX1 92 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CTDSP1Q9GZU7 261 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SMCO4Q9NRQ5 59 aa17.9■□□□□ 0.46
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa17.89■□□□□ 0.45
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