RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 NMES1Q9C002 83 aa13.66□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.66□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 H3BQ15 152 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC17A3O00476 420 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 SSNA1O43805 119 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 IGLC2P0DOY2 106 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 NHLH2Q02577 135 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 OR5C1Q8NGR4 320 aa13.65□□□□□ -0.22
ANKRD54-211ENST00000609454 THAP6Q8TBB0 222 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 C16orf74Q96GX8 76 aa13.64□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 H7BYZ3 331 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 J3KRW8 73 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 AZU1P20160 251 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 CLINT1Q14677 625 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAC2D3DTV9 90 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 F5H768 121 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PET100P0DJ07 73 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 LEPP41159 167 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 BLNKQ8WV28 456 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF586Q9NXT0 402 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.62□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF253O75346 499 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 IFITM3Q01628 133 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 FCN2Q15485 313 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PRELID1Q9Y255 219 aa13.61□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 M0R2N4 97 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ATG101Q9BSB4 218 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 MARVELD1Q9BSK0 173 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.6□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5G1P05496 136 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PYYP10082 97 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5G3P48201 142 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 BATF3Q9NR55 127 aa13.59□□□□□ -0.23
ANKRD54-211ENST00000609454 CBY3A6NI87 242 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 SNURFLB1AK76 121 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 PDE6HQ13956 83 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 NUDT3O95989 172 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 IFNA5P01569 189 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 CT45A10P0DMU9 189 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 RNF212Q495C1 297 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 ODF3Q96PU9 254 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 OR51M1Q9H341 326 aa13.57□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 H0YIZ8 118 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 M0R3E3 92 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 H2BFSP57053 126 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 ERCC8Q13216 396 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 KIR3DS1Q14943 382 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC00477Q96M19 166 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5SQ99766 215 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 PAXXQ9BUH6 204 aa13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 ICAM4Q14773 271 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM78Q5T7P6 136 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 OR7C2O60412 319 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 MPC2O95563 127 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 HSPB11Q9Y547 144 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 NDUFB4O95168 129 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 OR10J4P0C629 311 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 CSN1S1P47710 185 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 OR5I1Q13606 314 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-211ENST00000609454 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms