RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PRD5 423 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R1W7 72 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CORTO00230 105 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV1-47P01700 117 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV2-23P01705 113 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCL1P09341 107 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5G3P0C626 314 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LYNX1P0DP58 116 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFA4P12838 97 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 COX7A1P24310 79 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GCHFRP30047 84 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10J1P30954 320 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM3P40198 252 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GALR1P47211 349 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2G2P60604 165 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SELENOTP62341 195 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LCN2P80188 198 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TNXAQ16473 311 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM78BQ5VT40 261 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PNKDQ8N490 385 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPEQ96AT9 228 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM210BQ96KR6 192 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PFDN5Q99471 154 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF5Q99942 180 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PRORYQ9H606 182 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GNB4Q9HAV0 340 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 DOK5Q9P104 306 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRK2Q5S007 2527 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 BSNQ9UPA5 3926 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 POLEQ07864 2286 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C9JCJ5 164 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP5D1E7EU14 171 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 COX7A2P2O60397 106 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR7C2O60412 319 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00869P0C866 280 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM6P0DI80 62 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf88P0DMB2 117 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CD99P14209 185 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR1DP28221 377 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 WT1-ASQ06250 92 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PLGLAQ15195 96 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG5Q15238 335 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS8Q16651 343 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZN92 141 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf223Q8N319 242 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N377 158 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 NECAP1Q8NC96 275 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ACY3Q96HD9 319 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IMMP2LQ96T52 175 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FBN2P35556 2912 aa3.12□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FBN3Q75N90 2809 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPR1 153 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PRE2 83 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLC7A0M8Q6 106 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF98A6NK75 572 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OOSP1A8MZH6 123 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 E7EUB6 86 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QKU1 62 aa3.11□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 234.2 ms