RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, human

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP10-208	ENST00000563386	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	LY6G6C	O95867	125 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	OR10J4	P0C629	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	IGLL5	B9A064	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386		M0R3E3	92 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	OR7C2	O60412	319 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	ZNF253	O75346	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	NDUFB4	O95168	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PRM2	P04554	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	C11orf94	C9JXX5	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386		J3KRW8	73 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	HTN1	P15515	57 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	OXA1L	Q15070	435 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	LINC01587	Q99440	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	CDKN1B	P46527	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PDE6H	Q13956	83 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	ICAM4	Q14773	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	TSPO	P30536	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	ERCC8	Q13216	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	ASB13	Q8WXK3	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	RAB2A	P61019	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP10-208	ENST00000563386	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	AZU1	P20160	251 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	LEP	P41159	167 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TAS2R45	P59539	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	LYST	Q99698	3801 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386		A0A1W2PPV4	95 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	HTN3	P15516	51 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	M6PR	P20645	277 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	ZNF266	Q14584	549 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TAS2R60	P59551	318 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	DAD1	P61803	113 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386		H7BYZ3	331 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	VGLL1	Q99990	258 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386		Q9H3A6	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	APLN	Q9ULZ1	77 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	RYR2	Q92736	4967 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	DEFB130B	P0DP73	79 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	DEFB130A	P0DP74	79 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	CSN1S1	P47710	185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP10-208	ENST00000563386	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.47	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms