RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	RLN2	P04090	185 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	AZU1	P20160	251 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKN1B	P46527	198 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM210B	Q96KR6	192 aa		15.44	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF253	O75346	499 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR3DS1	Q14943	382 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP6	Q8TBB0	222 aa		15.43	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	LYRM9	A8MSI8	78 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200		P0DMU3	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM231A	P0DMU4	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM231C	P0DMU5	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R60	P59551	318 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFA1	P59665	94 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFA3	P59666	94 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DAD1	P61803	113 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01587	Q99440	93 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB4	O95168	129 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CLINT1	Q14677	625 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200		H7BYZ3	331 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MPC2	O95563	127 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A10	P0DMU9	189 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PYY	P10082	97 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HTN3	P15516	51 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE6H	Q13956	83 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ODF3	Q96PU9	254 aa		15.38	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R3E3	92 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SSNA1	O43805	119 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FCN2	Q15485	313 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf74	Q96GX8	76 aa		15.37	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HTN1	P15515	57 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		15.36	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB130B	P0DP73	79 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB130A	P0DP74	79 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		15.35	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5S	Q99766	215 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PRELID1	Q9Y255	219 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB11	Q9Y547	144 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	BLNK	Q8WV28	456 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	NACA	E9PAV3	2078 aa		15.33	■□□□□ 0.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PKHD1	P08F94	4074 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PET100	P0DJ07	73 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LEP	P41159	167 aa		15.33	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC8	Q13216	396 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD5	Q96DB9	178 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51M1	Q9H341	326 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT9	Q9Y231	359 aa		15.32	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CBY3	A6NI87	242 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200		J3KRW8	73 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD2	Q9UBB5	411 aa		15.31	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KLLN	B2CW77	178 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5G1	P05496	136 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5G3	P48201	142 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ICAM4	Q14773	271 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF212	Q495C1	297 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF503	Q96F45	646 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00477	Q96M19	166 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		15.3	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PKD1	P98161	4303 aa		15.29	■□□□□ 0.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.3 ms