RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK2P24941 298 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CCL8P80075 99 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 LUZP6Q538Z0 58 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DNM1P34Q6PK57 102 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC00596Q86U02 117 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 LRP11Q86VZ4 500 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 BAP18Q8IXM2 172 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2T27Q8NH04 317 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PHB2Q99623 299 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.52□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf170A2RU37 121 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 H0Y980 276 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 BHLHE40O14503 412 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TGOLN2O43493 480 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC11BP0C7V7 166 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 OPRK1P41145 380 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 AKR1C2P52895 323 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 AKR1C1Q04828 323 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RHEBQ15382 184 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 Q5W150 140 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PDPNQ86YL7 162 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ORMDL3Q8N138 153 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TERB2Q8NHR7 220 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DERL3Q96Q80 235 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PRRT1Q99946 306 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 GGACTQ9BVM4 153 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 GNG8Q9UK08 70 aa3.51□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1B0GV90 55 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR75O95800 540 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CYB5AP00167 134 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CD14P08571 375 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NFYBP25208 207 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DDTP30046 118 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF12P61328 243 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DHRS2Q13268 280 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf83Q53S99 150 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 LYG2Q86SG7 212 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01551Q86U37 167 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf144Q96I85 54 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NMES1Q9C002 83 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST5Q9GZS9 411 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MED31Q9Y3C7 131 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.5□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 COX7A2P2O60397 106 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MED6O75586 246 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA5P01569 189 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CD3DP04234 171 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA6P05013 189 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CD5P06127 495 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 FGF7P21781 194 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTFRP26992 372 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MPIP34949 423 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SSR2P43308 183 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SULT1A2P50226 295 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFA6P56556 154 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RSU1Q15404 277 aa3.49□□□□□ -1.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.1 ms