RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 NDUFB4O95168 129 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 HBE1P02100 147 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 EMP1P54849 157 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 C12orf74Q32Q52 190 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZTC4 211 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 BLNKQ8WV28 456 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FUT9Q9Y231 359 aa6.57□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 M0R3E3 92 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 INSP01308 110 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PRM2P04554 102 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 CDKN1BP46527 198 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PDE6HQ13956 83 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 RRN3P1Q2M238 152 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 BAP18Q8IXM2 172 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 RNF141Q8WVD5 230 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ASB13Q8WXK3 278 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 AQP10Q96PS8 301 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PAXXQ9BUH6 204 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PRELID1Q9Y255 219 aa6.56□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 IGLL5B9A064 214 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LY6G6CO95867 125 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR10J4P0C629 311 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 CT45A10P0DMU9 189 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ZNF266Q14584 549 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ICAM4Q14773 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 KIR3DS1Q14943 382 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FXYD5Q96DB9 178 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ZNF503Q96F45 646 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LINC01587Q99440 93 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LYSTQ99698 3801 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 DKK2Q9UBU2 259 aa6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPV4 95 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR7C2O60412 319 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 AZU1P20160 251 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 M6PRP20645 277 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TSPOP30536 169 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R45P59539 299 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ERCC8Q13216 396 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.54□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 RNF222A6NCQ9 220 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 J3KRW8 73 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 HTN1P15515 57 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LEPP41159 167 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TCTAP57738 103 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TAS2R60P59551 318 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 RANP62826 216 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 KHDC3LQ587J8 217 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 LINC00477Q96M19 166 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 ODF3Q96PU9 254 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 APLNQ9ULZ1 77 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.53□□□□□ -1.36
SYN3-211ENST00000472027 TENM2Q9NT68 2774 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 G3V3Q6 166 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 H7BYZ3 331 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V0CP27449 155 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 RAB2AP61019 212 aa6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SYN3-211ENST00000472027 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.52□□□□□ -1.37
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