RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 G3V3Q6 166 aa10.73□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 M0R3E3 92 aa10.73□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF503Q96F45 646 aa10.73□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa10.73□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 RNF222A6NCQ9 220 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 INSP01308 110 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 AMBPP02760 352 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 PRM2P04554 102 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 OR10J4P0C629 311 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6HQ13956 83 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 KIR3DS1Q14943 382 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 ASB13Q8WXK3 278 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD5Q96DB9 178 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 PAXXQ9BUH6 204 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 OR51M1Q9H341 326 aa10.72□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZTC4 211 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.71□□□□□ -0.69
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM9A6NGZ8 99 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR7C2O60412 319 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HBE1P02100 147 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 EMP1P54849 157 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RAB2AP61019 212 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf74Q32Q52 190 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RNF141Q8WVD5 230 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.7□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 SMLR1H3BR10 107 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 JTBO76095 146 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A10P0DMU9 189 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 M6PRP20645 277 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CDKN1BP46527 198 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ERCC8Q13216 396 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF266Q14584 549 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ICAM4Q14773 271 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RRN3P1Q2M238 152 aa10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V0CP27449 155 aa10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 KHDC3LQ587J8 217 aa10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 PRELID1Q9Y255 219 aa10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 VPS13DQ5THJ4 4388 aa10.68□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM189A5PLL7 270 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 J3KRW8 73 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 FAM222AQ5U5X8 452 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 DKK2Q9UBU2 259 aa10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf94C9JXX5 98 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 SPART-AS1P0CW21 52 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 AZU1P20160 251 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R45P59539 299 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ODF3Q96PU9 254 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01587Q99440 93 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 Q9H3A6 140 aa10.66□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 RANP62826 216 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 VGLL1Q99990 258 aa10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.65□□□□□ -0.7
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPV4 95 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 IGLL5B9A064 214 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 ARPC5O15511 151 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TSPOP30536 169 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LEPP41159 167 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.64□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 KMT2AQ03164 3969 aa10.63□□□□□ -0.71
CSAG1-201ENST00000361211 LY6G6CO95867 125 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 292.1 ms