RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.67■□□□□ 0.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 NCR2O95944 276 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 PSG3Q16557 428 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00477Q96M19 166 aa16.62■□□□□ 0.25
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PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZSR3 168 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 FXYD7P58549 80 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 POU2AF1Q16633 256 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-208ENST00000615445 COTL1Q14019 142 aa16.55■□□□□ 0.24
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