RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589252.5

ATP5A1-208, Transcript of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, human

TSL 5

Gene ATP5A1, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP5A1-208	ENST00000589252	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	CXCL3	P19876	107 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	ASAH1	Q13510	395 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	INS	P01308	110 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	CAMLG	P49069	296 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	RAB32	Q13637	225 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	MORN5	Q5VZ52	161 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ATP5A1-208	ENST00000589252	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252		H3BTX0	84 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	OPCML	Q14982	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	PSG3	Q16557	428 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	PRM2	P04554	102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	CXCL2	P19875	107 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	SULT1A1	P50225	295 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	RHOB	P62745	196 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	IL15RA	Q13261	267 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	SLC17A3	O00476	420 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	UPK1B	O75841	260 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	HTN3	P15516	51 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	BAX	Q07812	192 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	RAB31	Q13636	194 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	STX12	Q86Y82	276 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252		Q6ZRG5	221 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252		A6NHS1	94 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	SIX6	O95475	246 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	S100A11	P31949	105 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	HBG1	P69891	147 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	HBG2	P69892	147 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	IFITM3	Q01628	133 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252		H3BQ15	152 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	FGF7	P21781	194 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	B2M	P61769	119 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	DAD1	P61803	113 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP5A1-208	ENST00000589252		P0DMU3	169 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	OXA1L	Q15070	435 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	PFDN5	Q99471	154 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	AZU1	P20160	251 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	LINC01587	Q99440	93 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	CDKN1B	P46527	198 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.81	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	HTN1	P15515	57 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	TSPO	P30536	169 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	NHLH2	Q02577	135 aa		13.8	□□□□□ -0.2
ATP5A1-208	ENST00000589252	ATP6V1F	Q16864	119 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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