RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC01619G3V211 115 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRY3O43610 288 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFS5O43920 106 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1D-16P01601 117 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3-7P01780 117 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 C1QAP02745 245 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 GYPBP06028 91 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL1P22362 96 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NMSQ5H8A3 153 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM57BQ71RH2 274 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NABP1Q96AH0 204 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GTL3 188 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 A8MWL6 223 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 J3QT63 122 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLL1P15814 213 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 MPV17P39210 176 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NPC2P61916 151 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 WFDC2Q14508 124 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM230Q96A57 120 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 METTL26Q96S19 204 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 MGST2Q99735 147 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PRO0461Q9UI25 63 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SCN2AQ99250 2005 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0A6YYD4 124 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A0G2JNJ9 132 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ATOX1O00244 68 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TRIAP1O43715 76 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PDCD6O75340 191 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 CST7O76096 145 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 IL3RAP26951 378 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 BAGE3Q86Y29 109 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 BAGE2Q86Y30 109 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00311Q8N616 119 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF182Q8N6D2 247 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SPRY4Q9C004 299 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 Q9UFV3 132 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 E9PLD3 99 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf98E9PRG8 122 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 F5H697 171 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BT86 120 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 LGALS9O00182 355 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PRYO14603 147 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PRRG2O14669 202 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 EPPINO95925 133 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP1B1P05026 303 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 C3orf79P0CE67 100 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 COX8AP10176 69 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PAX8Q06710 450 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 AMN1Q8IY45 258 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF114Q8NC26 417 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 PAXXQ9BUH6 204 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 GNB4Q9HAV0 340 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 BSNQ9UPA5 3926 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 hDV102S1A0JD36 115 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFB3O43676 98 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 SERF1AO75920 110 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-214ENST00000497648 COX6A1P12074 109 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.3 ms