RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TIMM23O14925 209 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-39P01824 125 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CBLN1P23435 193 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TCL1AP56279 114 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 HES1Q14469 280 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 Q56UQ5 140 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MUC21Q5SSG8 566 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PATE2Q6UY27 113 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 BLNKQ8WV28 456 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LIPFP07098 398 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PF4V1P10720 104 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LCN12Q6JVE5 192 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 OR4A5Q8NH83 315 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TIMD4Q96H15 378 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 S4R3C0 116 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 24.8
HERC4-211ENST00000492996 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PAXXQ9BUH6 204 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SMPXQ9UHP9 88 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TEX45Q8NA69 505 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PSMB11A5LHX3 300 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 F2Z2F3 143 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 WIPF1O43516 503 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SCGB1A1P11684 91 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CTRLP40313 264 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GNG5P63218 68 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TIGITQ495A1 244 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RBP4P02753 201 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 HTR1DP28221 377 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LCN2P80188 198 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 Q8N2B8 174 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C11orf52Q96A22 123 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.55□□□□□ -1.52
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HERC4-211ENST00000492996 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RNF114Q9Y508 228 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GPX1P07203 203 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CRYGBP07316 175 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGLC1P0CG04 106 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IER3P46695 156 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LYZP61626 148 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 HSD52Q0P140 79 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FOXL1Q12952 345 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 DPM3Q9P2X0 92 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRE2 83 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C7orf71A4D174 169 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TEX22C9J3V5 150 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IL36BQ9NZH7 164 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FLNCQ14315 2725 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FAM231BA6NCW3 169 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C9JCJ5 164 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 J3QR89 54 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TYMSP04818 313 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 THAP8Q8NA92 274 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 JMJD8Q96S16 334 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PGPA6NDG6 321 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SNURFLB1AK76 121 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 H3BUT2 72 aa5.53□□□□□ -1.52
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