RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-213ENST00000492657 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-213ENST00000492657 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-213ENST00000492657 C18orf32Q8TCD1 76 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-213ENST00000492657 ACACBO00763 2458 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 ZNF785A8K8V0 405 aa10.08□□□□□ -0.8
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