RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC5	O15511	151 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTA	P57738	103 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	GUK1	Q16774	197 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM78B	Q5VT40	261 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	RPRM	Q9NS64	109 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12.61	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087X0K7	114 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	MIF	P14174	115 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL2	P19875	107 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.6	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOB	P62745	196 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.59	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0D9SG52	128 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PPV4	95 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HMSD	A8MTL9	139 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	MB	P02144	154 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R45	P59539	299 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		12.58	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF222	A6NCQ9	220 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	SMLR1	H3BR10	107 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	SOCS3	O14543	225 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	SERF2	P84101	59 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.57	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BMM0	161 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	M6PR	P20645	277 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF345	Q14585	488 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8NAQ8	132 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.56	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRB4	P13762	266 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG9	Q00887	426 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PMS2P11	Q13670	270 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KHDC3L	Q587J8	217 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP14	Q86UN6	197 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		12.55	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V3Q6	166 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7C2	O60412	319 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0C	P27449	155 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG3	Q16557	428 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	NEU1	Q99519	415 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PAXX	Q9BUH6	204 aa		12.54	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	AGRN	O00468	2067 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PFDN1	O60925	122 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF253	O75346	499 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE6H	Q13956	83 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424		X6R8D5	127 aa		12.53	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	C4BPB	P20851	252 aa		12.52	□□□□□ -0.41

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