RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6-208ENST00000478914 OXA1LQ15070 435 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 PSG3Q16557 428 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 AMTNQ6UX39 209 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 NUDT15Q9NV35 164 aa6.24□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 HERC2O95714 4834 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 PLA2G10O15496 165 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CXCL2P19875 107 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CXCL3P19876 107 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CAV2P51636 162 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 LCN15Q6UWW0 184 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 Q6ZRG5 221 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 BAP18Q8IXM2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 C17orf77Q96MU5 243 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC32Q9BV29 185 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.23□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 LYRM9A8MSI8 78 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CAMLGP49069 296 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 S100A10P60903 97 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 PATE2Q6UY27 113 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 C2orf50Q96LR7 162 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 LINC01587Q99440 93 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.22□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 NACAE9PAV3 2078 aa6.21□□□□□ -1.41
XRCC6-208ENST00000478914 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 CST7O76096 145 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 HTN1P15515 57 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 TSPOP30536 169 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 HBG1P69891 147 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 HBG2P69892 147 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 BAXQ07812 192 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ARL16Q0P5N6 197 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 STX12Q86Y82 276 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 S100ZQ8WXG8 99 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 C16orf74Q96GX8 76 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 PFDN5Q99471 154 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 MGST2Q99735 147 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.21□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 M0R2N4 97 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 DEFB130BP0DP73 79 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 DEFB130AP0DP74 79 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 S100A11P31949 105 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 CDKN1BP46527 198 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 SULT1A1P50225 295 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 TAS2R60P59551 318 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 GUK1Q16774 197 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 RNF212Q495C1 297 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.2□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 KMT2AQ03164 3969 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 F5H768 121 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 H3BTX0 84 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 PRM2P04554 102 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ATP5G1P05496 136 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 FGF7P21781 194 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ATP5G3P48201 142 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 RAB32Q13637 225 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 OPCMLQ14982 345 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ATP6V1FQ16864 119 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 MIC13Q5XKP0 118 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ENKURQ8TC29 256 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 ATG101Q9BSB4 218 aa6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
XRCC6-208ENST00000478914 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms