RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM210B	Q96KR6	192 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	GGACT	Q9BVM4	153 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1B0GVY2	172 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	INS	P01308	110 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TSPO	P30536	169 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PSG3	Q16557	428 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDT15	Q9NV35	164 aa		8.46	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC17A3	O00476	420 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RTL8C	O15255	209 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CXCL2	P19875	107 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	AZU1	P20160	251 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	OPCML	Q14982	345 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	VWC2	Q2TAL6	325 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC32	Q9BV29	185 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PKHD1	P08F94	4074 aa		8.45	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	IGSF23	A1L1A6	192 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	GOSR2	O14653	212 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLC2	P0DOY2	106 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	HTN3	P15516	51 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	DAD1	P61803	113 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LCN15	Q6UWW0	184 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZR54	194 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	C2orf50	Q96LR7	162 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PKD1	P98161	4303 aa		8.44	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LYRM9	A8MSI8	78 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PRAC2	D3DTV9	90 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		H3BQ15	152 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		H3BTX0	84 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CST7	O76096	145 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	B2M	P61769	119 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR3DS1	Q14943	382 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	S100A7A	Q86SG5	101 aa		8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	8.43	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	C5orf51	A6NDU8	294 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM25E	A8MYX2	175 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		L7N2F9	121 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R2N4	97 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	COX7A2P2	O60397	106 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CAMLG	P49069	296 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CAV2	P51636	162 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	VAMP2	P63027	116 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB32	Q13637	225 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF846	Q147U1	533 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	MIC13	Q5XKP0	118 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	8.42	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SULT1A1	P50225	295 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	BCAP31	P51572	246 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TAS2R60	P59551	318 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RHOB	P62745	196 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	FCN2	Q15485	313 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF212	Q495C1	297 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF24	Q9Y225	148 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB130B	P0DP73	79 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB130A	P0DP74	79 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	CDKN1B	P46527	198 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	ASAH1	Q13510	395 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01587	Q99440	93 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		8.4	□□□□□ -1.06
PTPRF-211	ENST00000467464	RYR1	P21817	5038 aa		8.4	□□□□□ -1.07

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