RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 OR2T8A6NH00 312 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 C2orf70A6NJV1 201 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 GNG7O60262 68 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 KLRB1Q12918 225 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 MUC21Q5SSG8 566 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 TIMD4Q96H15 378 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 RNF5Q99942 180 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 LY6DQ14210 128 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 SMIM12Q96EX1 92 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TPPP3Q9BW30 176 aa12.21□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 HLA-DMBP28068 263 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 ARPC1AQ92747 370 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CSN3P07498 182 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGLC3P0DOY3 106 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 OR4F17Q8NGA8 305 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 PSG8Q9UQ74 426 aa12.2□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CT83Q5H943 113 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 C1RLQ9NZP8 487 aa12.19□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 M0R1W7 72 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CEACAM3P40198 252 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 PSG3Q16557 428 aa12.18□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CHEK1O14757 476 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 Q8TAT8 98 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 LINC01548A6NM66 108 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 Q8N6K4 173 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.17□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGLL1P15814 213 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 BTF3P20290 206 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZN92 141 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZVH6 145 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 H0Y8G0 127 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TMEM11P17152 192 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 MFAP4P55083 255 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 AJUBAQ96IF1 538 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 TXN2Q99757 166 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 UBTD1Q9HAC8 227 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.16□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 NPIPB5A8MRT5 1133 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 CTSGP08311 255 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 FAM106CPP0CH98 169 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 STPG4Q8N801 248 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 PMCHL2Q9BQD1 86 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 SPG11Q96JI7 2443 aa12.15□□□□□ -0.46
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 Q8N9W7 124 aa12.15□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 TMEM213A2RRL7 107 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 HAX1O00165 279 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 ECSCRQ19T08 205 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 SIRPDQ9H106 197 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 IGHG4P01861 327 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 UQCRFS1P47985 274 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 VGLL1Q99990 258 aa12.14□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GUT8 65 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 hDV102S1A0JD36 115 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 C19orf84I3L1E1 186 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 NPSP0C0P6 89 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 LINC00614P0C842 121 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 G3V318 75 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 DTX2Q86UW9 622 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 FLNCQ14315 2725 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 GPR183P32249 361 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 FXYD7P58549 80 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-202ENST00000420808 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms