RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPB11Q9Y547 144 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 X6R8D5 127 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 CXorf65A6NEN9 183 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 MIFP14174 115 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 PMS2P11Q13670 270 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF709Q8N972 641 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8NAQ8 132 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF738Q8NE65 137 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL2P19875 107 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS21Q2M5E4 152 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 LCN15Q6UWW0 184 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5SQ99766 215 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 HRH4Q9H3N8 390 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BQ15 152 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BTX0 84 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLC2P0DOY2 106 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MTW9 85 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 MFFQ9GZY8 342 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNA5P01569 189 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 GUK1Q16774 197 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 AMTNQ6UX39 209 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC1Q9HC57 220 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNIP2Q9NS61 270 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC17A3O00476 420 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 OXA1LQ15070 435 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 NEU1Q99519 415 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 RYR3Q15413 4870 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 NUPR2A6NF83 97 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOBP62745 196 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 LCE6AA0A183 80 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 AMBPP02760 352 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 Q5BKY6 102 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A2Q9BXI2 301 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 TENM2Q9NT68 2774 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV19A0A075B6N1 114 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PYYP10082 97 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB13Q8WXK3 278 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAC2D3DTV9 90 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R2Z0 102 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF253O75346 499 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CRXO43186 299 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 BLNKQ8WV28 456 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 OR51M1Q9H341 326 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 FUT9Q9Y231 359 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 RFNGQ9Y644 331 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 JTBO76095 146 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB4O95168 129 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP10Q96PS8 301 aa15.18■□□□□ 0.02
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