RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LYRM9A8MSI8 78 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 J3QRK9 145 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 DCTN3O75935 186 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 YIF1AO95070 293 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 DEFA4P12838 97 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 HLA-GP17693 338 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 P2RY1P47900 373 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ACTR3P61158 418 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR5I1Q13606 314 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 Q56UQ5 140 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARPINQ7Z6K5 226 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMED4Q7Z7H5 227 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 GID4Q8IVV7 300 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 THTPAQ9BU02 230 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 REEP1Q9H902 201 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM138Q9NPI0 162 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa2.31□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A0J9YXV3 536 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 M0R2Z0 102 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 HBE1P02100 147 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 GLAP06280 429 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR13C7P0DN81 318 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 M6PRP20645 277 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 CRYBB3P26998 211 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 PAFAH1B2P68402 229 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 DHRS2Q13268 280 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 INSL4Q14641 139 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATP6AP1Q15904 470 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RTL8BQ17RB0 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RRN3P1Q2M238 152 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 BAP18Q8IXM2 172 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC25A46Q96AG3 418 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LINC00477Q96M19 166 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 AP3M1Q9Y2T2 418 aa2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM212A6NML5 194 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 UPK2O00526 184 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LIMS3P0CW19 117 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LIMS4P0CW20 117 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 CRHBPP24387 322 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 CLDN12P56749 244 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 KRTAP12-4P60329 112 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ACSM3Q53FZ2 586 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM78BQ5VT40 261 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 OR5AK2Q8NH90 309 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RMI2Q96E14 147 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SPXQ9BT56 116 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LPAR5Q9H1C0 372 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 LRRC42Q9Y546 428 aa2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A0J9YX75 114 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 DAPL1A0PJW8 107 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM14DPA8MWL7 114 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRDCB7Z8K6 153 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 H3BNG1 76 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 MFNGO00587 321 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDUFAB1O14561 156 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TMEM50AO95807 157 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 MT-CO2P00403 227 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTHLHP12272 177 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 SRMP19623 302 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPOP30536 169 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 RORCP51449 518 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 KIAA0087Q14695 138 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAPRE2Q15555 327 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 TRIM16LQ309B1 348 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 KDM4DQ6B0I6 523 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 Q6ZTI0 123 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 JAGN1Q8N5M9 183 aa2.28□□□□□ -2.04
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZFP41Q8N8Y5 198 aa2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms