RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377327.8

CRNKL1-201, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CRNKL1, Length 4,370 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1-201ENST00000377327 ASIPP42127 132 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 Q6ZPA2 131 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 RNF138Q8WVD3 245 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 ERG28Q9UKR5 140 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 C15orf65H3BRN8 121 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 PCP2Q8IVA1 136 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 IGLV2-14P01704 120 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 IGHV4-39P01824 125 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 Q0VFX4 171 aa7.32□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 NKX2-8O15522 239 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 TNFRSF6BO95407 300 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 CEND1Q8N111 149 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF134P52741 427 aa7.31□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 FAM106CPP0CH98 169 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.31□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 DKK2Q9UBU2 259 aa7.31□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.31□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 PRSS46E5RG02 174 aa7.31□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.31□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 C17orf100A8MU93 164 aa7.3□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 TAL2Q16559 108 aa7.3□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.28□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.28□□□□□ -1.24
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CRNKL1-201ENST00000377327 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 Q6ZR03 302 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 GAFA1Q96PS6 74 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 RNF114Q9Y508 228 aa7.28□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.27□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 P0C879 139 aa7.27□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 GAGE5Q13069 117 aa7.27□□□□□ -1.24
CRNKL1-201ENST00000377327 GAGE6Q13070 117 aa7.27□□□□□ -1.24
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