RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366988.4

NENF-201, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NENF, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-201ENST00000366988 PRR20BP86481 221 aa14.66□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 PRR20AP86496 221 aa14.66□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.66□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.66□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 MPDU1O75352 247 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 CXCL2P19875 107 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 NHLH2Q02577 135 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 OPCMLQ14982 345 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 LCN15Q6UWW0 184 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.65□□□□□ -0.06
NENF-201ENST00000366988 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PET100P0DJ07 73 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 CXCL3P19876 107 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 NEU1Q99519 415 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.64□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 A8MTW9 85 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 HLA-DMBP28068 263 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PSG3Q16557 428 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 MORN5Q5VZ52 161 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 THAP6Q8TBB0 222 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.63□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 C11orf94C9JXX5 98 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 H0YIZ8 118 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 LY6G6CO95867 125 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 AMBPP02760 352 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 CLINT1Q14677 625 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 AMTNQ6UX39 209 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.62□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 RFNGQ9Y644 331 aa14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 TMEM189A5PLL7 270 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 H3BTX0 84 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 MPC2O95563 127 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 PTTG1O95997 202 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 IGLC2P0DOY2 106 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 RHOBP62745 196 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 CELA1Q9UNI1 258 aa14.6□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 M0R2Z0 102 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 INSP01308 110 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 HBE1P02100 147 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 EMP1P54849 157 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 GUK1Q16774 197 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 Q6ZTC4 211 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 ALG5Q9Y673 324 aa14.59□□□□□ -0.07
NENF-201ENST00000366988 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.58□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 SLC17A3O00476 420 aa14.58□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.58□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 RNF126Q9BV68 326 aa14.58□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 H3BQ15 152 aa14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 RRN3P1Q2M238 152 aa14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 ATP5SQ99766 215 aa14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 IGLL5B9A064 214 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 BAP18Q8IXM2 172 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 MBD2Q9UBB5 411 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 HSPB11Q9Y547 144 aa14.56□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 TCTAP57738 103 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 C12orf74Q32Q52 190 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.55□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.54□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NENF-201ENST00000366988 ZNF253O75346 499 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms