RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 SC5DO75845 299 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FLOT2Q14254 428 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 GRK1Q15835 563 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR10J3Q5JRS4 329 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 STOML3Q8TAV4 291 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 GGACTQ9BVM4 153 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 BIN3Q9NQY0 253 aa-2.85□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC13O75165 2243 aa-2.85□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 A8MWV9 139 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-2.86□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 LIMS4P0CW20 117 aa-2.87□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 SLAMF6Q96DU3 332 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIST1H2BLQ99880 126 aa-2.87□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 DAPL1A0PJW8 107 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 HIGD1CA8MV81 97 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXCL3P19876 107 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLRXP35754 106 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC42P60953 191 aa-2.88□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM96AQ9H5X1 160 aa-2.88□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-2.88□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A087X0T9 212 aa-2.89□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 STMN3Q9NZ72 180 aa-2.9□□□□□ -2.87
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM94Q12767 1356 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYO9AB2RTY4 2548 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 COL24A1Q17RW2 1714 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP-2.91□□□□□ -2.87
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPINK4O60575 86 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCRBP04435 133 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRYGCP07315 174 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHRS9Q9BPW9 319 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-162P-201ENST00000516228 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-2.91□□□□□ -2.88
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