RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730		F2Z2F3	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730		J3QLI3	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	NBR2	O15453	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	TOX4	O94842	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFB8	O95169	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	PSG1	P11464	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	ORM2	P19652	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	GATA3	P23771	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CX3CL1	P78423	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	EBI3	Q14213	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	FXYD3	Q14802	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	MMD	Q15546	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF2	Q99496	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	PEX7	O00628	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	ISLR	O14498	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	HYPM	O75409	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	FABP4	P15090	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SRD5A1	P18405	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CBLN1	P23435	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	S100P	P25815	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R45	P59539	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SELENOT	P62341	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	SSX2	Q16385	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N9W7	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	ASCL2	Q99929	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CR1	P17927	2039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
C4BPB-208	ENST00000492730	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	PGP	A6NDG6	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BRN7	92 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	SPINK4	O60575	86 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	FABP1	P07148	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	GNG4	P50150	75 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	TCL1A	P56279	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R60	P59551	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	BPIFB3	P59826	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	LYZ	P61626	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	CTAG1A	P78358	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	PFDN5	Q99471	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730		Q9H3A6	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
C4BPB-208	ENST00000492730	MAST4	O15021	2626 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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