RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	DFFB	O76075	338 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFB4	O95168	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2C1	O95371	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMB	P08949	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMLG	P49069	296 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFAP4	P55083	255 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL20	P78556	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CORT	O00230	105 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGOLN2	O43493	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA5	P01569	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYBA1	P05813	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULT1A2	P50226	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLP1	P60201	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q56UQ5	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXN2	Q99757	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOK5	Q9P104	306 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG7	O60262	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5G3	P0C626	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPBWR1	P48145	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	B2M	P61769	119 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF266	Q14584	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	CITED1	Q99966	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BRN7	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPDU1	O75352	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC35B1	P78383	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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