RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA5	P01569	189 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	PLP1	P60201	277 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.74	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7A2P2	O60397	106 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GALR1	P47211	349 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	CLINT1	Q14677	625 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	MGST2	Q99735	147 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	LYST	Q99698	3801 aa		12.73	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	PFDN5	Q99471	154 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5S	Q99766	215 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A22	Q9H936	323 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	DOK5	Q9P104	306 aa		12.72	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF98	A6NK75	572 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	ID1	P41134	155 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.71	□□□□□ -0.37
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EQG2	157 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	MEOX2	P50222	304 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	B2M	P61769	119 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB135	Q30KP9	77 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	ARV1	Q9H2C2	271 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		12.7	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.69	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YWU9	116 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BRN7	92 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF266	Q14584	549 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	OPCML	Q14982	345 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP10	Q96PS8	301 aa		12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SPP1	P10451	314 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB131A	P59861	70 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR20E	P86478	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR20C	P86479	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR20D	P86480	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR20B	P86481	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR20A	P86496	221 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	STH	Q8IWL8	128 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	RARRES2	Q99969	163 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	RSG1	Q9BU20	258 aa		12.67	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	UHRF2	Q96PU4	802 aa		12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		12.66	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF688	P0C7X2	276 aa		12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	PATE2	Q6UY27	113 aa		12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf92	Q96LL3	132 aa		12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	MFF	Q9GZY8	342 aa		12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	ISLR	O14498	428 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB3	P49720	205 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12.64	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF124	Q15973	351 aa		12.63	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424		Q5BKY6	102 aa		12.63	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00052	Q96N35	136 aa		12.63	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf65	A6NEN9	183 aa		12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	TAAR5	O14804	337 aa		12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZNX1	250 aa		12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		12.62	□□□□□ -0.39
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.62	□□□□□ -0.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms