RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 TIGITQ495A1 244 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01620Q4KN68 170 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 BADQ92934 168 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM54Q969K7 222 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 PSENENQ9NZ42 101 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 FANCMQ8IYD8 2048 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf98E9PRG8 122 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RER1O15258 196 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 UTS2O95399 124 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR9G9P0C7N8 305 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A10P0DMU9 189 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CPMP14384 443 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 COX5AP20674 150 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CATR1Q13166 79 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8B8Q15620 311 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ETDBQ3ZM63 59 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 NMSQ5H8A3 153 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 UTF1Q5T230 341 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZUT4 128 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR1L1Q8NH94 360 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ARPC1AQ92747 370 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RDH5Q92781 318 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 C20orf78Q9BR46 151 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM126AQ9H061 195 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RABAC1Q9UI14 185 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 V9GYV3 84 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 NCKAP5O14513 1909 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SPTBP11277 2137 aa3.07□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1B0GWB2 263 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PPV9 198 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 C9JCJ5 164 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 K7EN84 100 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNGR2O43760 224 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 FCN3O75636 299 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV1D-16P01601 117 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A6P0DMU7 189 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A5P0DMU8 189 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A7P0DMV0 189 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 FGF6P10767 208 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CTLA4P16410 223 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 INSL3P51460 131 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM215Q68D42 235 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 SSX8Q7RTT4 187 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX29Q8N6K0 151 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGGTB-210ENST00000485459 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms