RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 CAMLGP49069 296 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ATP6V1FQ16864 119 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CASC10Q5T4H9 136 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PATE2Q6UY27 113 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 LINC00052Q96N35 136 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 LYSTQ99698 3801 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ARV1Q9H2C2 271 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ALG5Q9Y673 324 aa7.13□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 COX7A2P2O60397 106 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PET100P0DJ07 73 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PRR20EP86478 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PRR20CP86479 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PRR20DP86480 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PRR20BP86481 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PRR20AP86496 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 NHLH2Q02577 135 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 BAXQ07812 192 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C16orf92Q96LL3 132 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C17orf77Q96MU5 243 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RNF24Q9Y225 148 aa7.12□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 A0A0J9YWU9 116 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 H3BMM0 161 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MPDU1O75352 247 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MPC2O95563 127 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 HLA-DRB4P13762 266 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C4BPBP20851 252 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 DEFB1P60022 68 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MIC13Q5XKP0 118 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 Q6ZRG5 221 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 IL17DQ8TAD2 202 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RARRES2Q99969 163 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RNF126Q9BV68 326 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.11□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CXCL3P19876 107 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 FGF7P21781 194 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 B2MP61769 119 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CLINT1Q14677 625 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 OPCMLQ14982 345 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 OR11H2Q8NH07 326 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 THAP6Q8TBB0 222 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C20orf173Q96LM9 149 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MED28Q9H204 178 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RPRMQ9NS64 109 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MBD2Q9UBB5 411 aa7.1□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RYR3Q15413 4870 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 A0A087X0K7 114 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 FGL1Q08830 312 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 RGS21Q2M5E4 152 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 MORN5Q5VZ52 161 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PFDN5Q99471 154 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.09□□□□□ -1.27
SRRT-208ENST00000469602 A0A0J9YX75 114 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 F6UB75 175 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 IGKV3-20P01619 116 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 CXCL2P19875 107 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 FCN2Q15485 313 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 FAM78BQ5VT40 261 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 RNF182Q8N6D2 247 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 ATP5SQ99766 215 aa7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SRRT-208ENST00000469602 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.08□□□□□ -1.28
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