RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	NAT8	Q9UHE5	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RBBP4-208	ENST00000463378	DYSF	O75923	2080 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RBBP4-208	ENST00000463378	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CD300LB	A8K4G0	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MWP6	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		H7BYZ3	331 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RER1	O15258	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF737	O75373	536 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV3-11	P04433	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CST2	P09228	141 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CECR9	P0C854	216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	BCL2	P10415	239 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10J1	P30954	320 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CAPZB	P47756	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DYNLT3	P51808	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST1H3A	P68431	136 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ADIRF	Q15847	76 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DDA1	Q9BW61	102 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR51I2	Q9H344	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TET1	Q8NFU7	2136 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	EP400	Q96L91	3159 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGSF23	A1L1A6	192 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PGP	A6NDG6	321 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		M0R135	149 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TP53I11	O14683	189 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	COX7A2P2	O60397	106 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PDCD6	O75340	191 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CST7	O76096	145 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NRAS	P01111	189 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PPY	P01298	95 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ORM1	P02763	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00869	P0C866	280 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	GZMB	P10144	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A6	P12236	298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NPY1R	P25929	384 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OPRM1	P35372	400 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PCBD1	P61457	104 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL20	P78556	96 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FOXF1	Q12946	379 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NEK7	Q8TDX7	302 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	REEP6	Q96HR9	211 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GX78	115 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GXF2	115 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		H0Y980	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM250	H0YL14	139 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HRAS	P01112	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00614	P0C842	121 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	G0S2	P27469	103 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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