RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 C20orf173Q96LM9 149 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 GPR82Q96P67 336 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 UHRF2Q96PU4 802 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 GGACTQ9BVM4 153 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 X6R8D5 127 aa11.75□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 F6UB75 175 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 CST7O76096 145 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 MIFP14174 115 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 ARL6Q9H0F7 186 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.74□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 AGPAT2O15120 278 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 FXYD7P58549 80 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 FGL1Q08830 312 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RAB32Q13637 225 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 ZNF546Q86UE3 836 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 MGST2Q99735 147 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 MFFQ9GZY8 342 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RPRMQ9NS64 109 aa11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 GOSR2O14653 212 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 IL15RAQ13261 267 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 PATE2Q6UY27 113 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 ARV1Q9H2C2 271 aa11.72□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 A0A0J9YX75 114 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 IGSF23A1L1A6 192 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 FAM78BQ5VT40 261 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 S100A7AQ86SG5 101 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 ZNF709Q8N972 641 aa11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RBM39-215ENST00000442447 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 SIX6O95475 246 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 RNF182Q8N6D2 247 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.7□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 COX7A2P2O60397 106 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PRAF2O60831 178 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 CAMLGP49069 296 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 SULT1A1P50225 295 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PSG9Q00887 426 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 STX12Q86Y82 276 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 HRH4Q9H3N8 390 aa11.69□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 A0A087X0K7 114 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 LY6G6CO95867 125 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 RAB31Q13636 194 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 VWC2Q2TAL6 325 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 MIC13Q5XKP0 118 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.68□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 HLA-DMBP28068 263 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 S100A11P31949 105 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 DEFA1P59665 94 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 DEFA3P59666 94 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 HBG1P69891 147 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 HBG2P69892 147 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 BAXQ07812 192 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 MORN5Q5VZ52 161 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 ZNF738Q8NE65 137 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 CELA1Q9UNI1 258 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 RNF24Q9Y225 148 aa11.67□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 A8MTW9 85 aa11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PRR20EP86478 221 aa11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PRR20CP86479 221 aa11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PRR20DP86480 221 aa11.66□□□□□ -0.54
RBM39-215ENST00000442447 PRR20BP86481 221 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms