RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 C5orf51A6NDU8 294 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF98A6NK75 572 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 L7N2F9 121 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 DEFA1P59665 94 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 DEFA3P59666 94 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 VAMP2P63027 116 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ARL16Q0P5N6 197 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 VWC2Q2TAL6 325 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 PSMG4Q5JS54 123 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF546Q86UE3 836 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SMCO3A2RU48 225 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 FAM25EA8MYX2 175 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 H3BRN7 92 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 LINC00869P0C866 280 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HLA-DRB4P13762 266 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 GALR1P47211 349 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 S100A7AQ86SG5 101 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 C17orf77Q96MU5 243 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 NMES1Q9C002 83 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RNF24Q9Y225 148 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 A0A0J9YWU9 116 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 KNCNA6PVL3 124 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 A8MTW9 85 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 H3BMM0 161 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 AGPAT2O15120 278 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HYPMO75409 117 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ORM2P19652 201 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 C4BPBP20851 252 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ID1P41134 155 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SULT1A1P50225 295 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CAV2P51636 162 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RAB32Q13637 225 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RARRES2Q99969 163 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.43□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 A0A087X0K7 114 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 IGSF23A1L1A6 192 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 GOSR2O14653 212 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CST7O76096 145 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 S100A11P31949 105 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 S100A10P60903 97 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RAP2BP61225 183 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HBG1P69891 147 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 HBG2P69892 147 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 STX12Q86Y82 276 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 OR11H2Q8NH07 326 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 MGST2Q99735 147 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 SLC25A22Q9H936 323 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.42□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 MPDU1O75352 247 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 OR5G3P0C626 314 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 MIFP14174 115 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 CAMLGP49069 296 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 BCAP31P51572 246 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 H2BFSP57053 126 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RAB31Q13636 194 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ATP6V1FQ16864 119 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 PATE2Q6UY27 113 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 Q8NAQ8 132 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 UHRF2Q96PU4 802 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 RSG1Q9BU20 258 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00963-204ENST00000427778 ARL6Q9H0F7 186 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105 ms