RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 FXYD5Q96DB9 178 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF503Q96F45 646 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 S4R3C0 116 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 INAFM1C9JVW0 142 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 APOC3P02656 99 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 RPEL1Q2QD12 228 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01006Q8NI28 216 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf52Q96A22 123 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00052Q96N35 136 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 DUX5Q96PT3 197 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 OTORQ9NRC9 128 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-211ENST00000425989 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.4□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 HELTA6NFD8 242 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF727A8MUV8 499 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C9JQL5 133 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-11P01762 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 GP9P14770 177 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TAS2R60P59551 318 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 REC114Q7Z4M0 266 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 DPF1Q92782 380 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TVP23CQ96ET8 276 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087X0K7 114 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 PGPA6NDG6 321 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF785A8K8V0 405 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 PPP5D1E7EU14 171 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 K7EQM0 130 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 OR10J4P0C629 311 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 IGLC2P0DOY2 106 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 MYCNOSP40205 109 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2G2P60604 165 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 DEFA5Q01523 94 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 MORN5Q5VZ52 161 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM12Q96EX1 92 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 NAT8Q9UHE5 227 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 EPDR1Q9UM22 224 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 RNF114Q9Y508 228 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 AKAP9Q99996 3911 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF320A2RRD8 509 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01619G3V211 115 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 PYYP10082 97 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CSN1S1P47710 185 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 RANP62826 216 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 FOXL1Q12952 345 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 RHEBQ15382 184 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C1QL4Q86Z23 238 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 BIN3Q9NQY0 253 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 PEMTQ9UBM1 199 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 SMPXQ9UHP9 88 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 A8MWP6 167 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 C9JCJ5 164 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 H3BQ15 152 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 M0QZ24 198 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFB4O95168 129 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5G3P48201 142 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 LEMD1Q68G75 181 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-211ENST00000425989 BLNKQ8WV28 456 aa7.36□□□□□ -1.23
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