RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0A6YYD4 124 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0J9YXY3 114 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 FSTL3O95633 263 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TDGF1P13385 188 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 KIR3DS1Q14943 382 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 STPG4Q8N801 248 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 UCN2Q96RP3 112 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 H3BUT2 72 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SPINK8P0C7L1 97 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf82Q6UX34 121 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 NUP35Q8NFH5 326 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 LYRM9A8MSI8 78 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 VWC2LB2RUY7 222 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 K7EM74 188 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 ZNHIT1O43257 154 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-13P01766 116 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 FXYD3Q14802 87 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 F8VRH5 84 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE12JA6NER3 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA8B8ZZ34 492 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE7O76087 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE12FP0CL80 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE12GP0CL81 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE12IP0CL82 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 IGFBP2P18065 325 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE4Q13068 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TREML4Q6UXN2 200 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 DUX3Q96PT4 197 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf77C9JDV5 145 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CGAP01215 116 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 IMMP1LQ96LU5 166 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM89A2RUT3 159 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 THBDP07204 575 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL5P42830 114 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CEND1Q8N111 149 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 M0QXV9 152 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 COX7A1P24310 79 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 HERVK_113P63121 156 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 RMI2Q96E14 147 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRD-201ENST00000355233 C9orf172C9J069 976 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TCRAP04437 139 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 IGLC2P0DOY2 106 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 IGLC3P0DOY3 106 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 WNT5AP41221 380 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TGIF1Q15583 401 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 Q5BKY6 102 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB125Q8N687 156 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 OCC1Q8TAD7 63 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GLI4P10075 376 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SPINK4O60575 86 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF6BO95407 300 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPB3Q92617 1050 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CSTL1Q9H114 145 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 LIME1Q9H400 295 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRD-201ENST00000355233 J3QLI3 93 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRD-201ENST00000355233 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf100A8MU93 164 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 J3QKU1 62 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CTSBP07858 339 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF137PP52743 207 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 NPYP01303 97 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 CD55P08174 381 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 WBP1Q96G27 269 aa4.03□□□□□ -1.76
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