RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 M0R2P5 195 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 GBF1Q92538 1859 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 LCTP09848 1927 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFS7O75251 213 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NAPSAO96009 420 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NMBP08949 121 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 THAP8Q8NA92 274 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 PRSS33Q8NF86 280 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SH2D1AO60880 128 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 C18orf12Q96KH6 178 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BUT2 72 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1D-12P01611 117 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 AZU1P20160 251 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.68□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 FREM3P0C091 2139 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 D6R8Y8 96 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM126AQ9H061 195 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 H0YJW9 148 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF144BQ7Z419 303 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 BMPERQ8N8U9 685 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 REG4Q9BYZ8 158 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 C22orf46C9J442 243 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.67□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZQT7 251 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFS5O43920 106 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1-5P01602 117 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 MDS2Q8NDY4 140 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MXK9 166 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 DPM2O94777 84 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKCP01834 107 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 LAGE3Q14657 143 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1-39P01597 117 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1D-39P04432 117 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 GGACTQ9BVM4 153 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.66□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 NIT1Q86X76 327 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 OCC1Q8TAD7 63 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SERF1AO75920 110 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.65□□□□□ -0.86
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF138P52744 262 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 HGFACQ04756 655 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 C8orf49Q96NF6 230 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6V0BQ99437 205 aa9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFSF13O75888 250 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV1-69P01742 117 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM6P0DI80 62 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 IGKV1-16P04430 117 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZS92 163 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GV90 55 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 M0R1W7 72 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 APOC4P55056 127 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 MST1LQ2TV78 715 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 PLNP26678 52 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE2BP63146 152 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.64□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF98A6NK75 572 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 HEPN1Q6WQI6 88 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 MGST2Q99735 147 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 PRTN3P24158 256 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 WFDC1Q9HC57 220 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 SRRM5B3KS81 715 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 K7EM74 188 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 DYSFO75923 2080 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00473A8K010 186 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 ITGB1BP1O14713 200 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 DEFB4AO15263 64 aa9.63□□□□□ -0.87
UBASH3B-201ENST00000284273 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms