RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	SNAPC2	Q13487	334 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	DCAF15	Q66K64	600 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	BRCA2	P51587	3418 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PRDX5	P30044	214 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	TCP10	Q12799	353 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	NFIA	Q12857	509 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGEF6	Q15052	776 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	FAM151A	Q8WW52	585 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	GCC1	Q96CN9	775 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	HOOK2	Q96ED9	719 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	SIL1	Q9H173	461 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CTGF	P29279	349 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PPAT	Q06203	517 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	NBPF11	Q86T75	865 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	KIF22	Q14807	665 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PDHX	O00330	501 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CIAO1	O76071	339 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PHKA1	P46020	1223 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	MOGS	Q13724	837 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ADORA1	P30542	326 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	PSMC4	P43686	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RPS5-208	ENST00000599909	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	GNRH1	P01148	92 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	OSBP	P22059	807 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	RGS3	P49796	1198 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	PRMT2	P55345	433 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	MTFR1	Q15390	333 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	MEIS3	Q99687	375 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	GAK	O14976	1311 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	SEMA3E	O15041	775 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	MGAM	O43451	1857 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	PTPRF	P10586	1907 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	CYP2C8	P10632	490 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	CXCL11	O14625	94 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	ZBTB22	O15209	634 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	ENTPD3	O75355	529 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RPS5-208	ENST00000599909	BCR	P11274	1271 aa		13.92	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms