RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561068.5

RPS17-208, Transcript of ribosomal protein S17, human

TSL 3

Gene RPS17, Length 522 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS17-208	ENST00000561068	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	FOXO4	P98177	505 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	LINS1	Q8NG48	757 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	PRR7	Q8TB68	274 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	KIFC2	Q96AC6	838 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	POLL	Q9UGP5	575 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS17-208	ENST00000561068	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		6.09	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	YDJC	A8MPS7	323 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	HSPA6	P17066	643 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CTSW	P56202	376 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	GPSM2	P81274	684 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	FSTL1	Q12841	308 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	AOC3	Q16853	763 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	MPND	Q8N594	471 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	KAZALD1	Q96I82	304 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ZFP42	Q96MM3	310 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	GREM2	Q9H772	168 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	UTY	O14607	1347 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SCNN1D	P51172	638 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CXCL9	Q07325	125 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	GPC2	Q8N158	579 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PPIP5K2	O43314	1243 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	EPS15	P42566	896 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	JDP2	Q8WYK2	163 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PTPRC	P08575	1304 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	GRM8	O00222	908 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ALDH1L1	O75891	902 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ITGA6	P23229	1130 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CTH	P32929	405 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	EPHX2	P34913	555 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	HTRA3	P83110	453 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	KCNH2	Q12809	1159 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NNT	Q13423	1086 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ARID5B	Q14865	1188 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	WASHC4	Q2M389	1173 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	NIM1K	Q8IY84	436 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF511	Q8NB15	262 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	USP44	Q9H0E7	712 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	HACL1	Q9UJ83	578 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PASK	Q96RG2	1323 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PSMD14	O00487	310 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	RAD17	O75943	681 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	PTPRN	Q16849	979 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS17-208	ENST00000561068	SUCLG2	Q96I99	432 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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