RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	CTGF	P29279	349 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TNNI2	P48788	182 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	BCAM	P50895	628 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	MOGS	Q13724	837 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ANP32C	O43423	234 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	PPIL2	Q13356	520 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	C17orf99	Q6UX52	265 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CETP	P11597	493 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	GNRH1	P01148	92 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	INPP5B	P32019	993 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	PPAT	Q06203	517 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PCBP2-222	ENST00000552296	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MAST3	O60307	1309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPRC	P08575	1304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PRMT2	P55345	433 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	NFIA	Q12857	509 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MTFR1	Q15390	333 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	EYA2	O00167	538 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	BCR	P11274	1271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	OSBP	P22059	807 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PRDX5	P30044	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PRO3102	Q9H379	93 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296		H0YGN5	161 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PDHX	O00330	501 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	LPIN2	Q92539	896 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PCBP2-222	ENST00000552296	PSMC4	P43686	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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