RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 DEFB118Q96PH6 123 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 PLA2G12BQ9BX93 195 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 CHMP3Q9Y3E7 222 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ALPK3Q96L96 1907 aa17.46■□□□□ 0.39
CS-231ENST00000552222 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 TFRCP02786 760 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 BCAMP50895 628 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 PRMT2P55345 433 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FOXO4P98177 505 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 MTMR10Q9NXD2 777 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 GNRH1P01148 92 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 NEXNQ0ZGT2 675 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 PPIL2Q13356 520 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 GDF15Q99988 308 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FAM205AQ6ZU69 1335 aa17.44■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 INHAP05111 366 aa17.43■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 ADCY3O60266 1144 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 SLURP2P0DP57 97 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 UBXN2AP68543 259 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa17.42■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 CACNA1FO60840 1977 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PPC1 479 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 HOXD10P28358 340 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FLT3LGP49771 235 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 STK31Q9BXU1 1019 aa17.41■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 SLC4A2P04920 1241 aa17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 BCRP11274 1271 aa17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 TNNI2P48788 182 aa17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 FAM161BQ96MY7 647 aa17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CS-231ENST00000552222 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 TRIM32Q13049 653 aa17.39■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 LMBR1LQ6UX01 489 aa17.39■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 FCGRTP55899 365 aa17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 PPATQ06203 517 aa17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 CNNM1Q9NRU3 951 aa17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 VCANP13611 3396 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 F6X3S4 739 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 TCP10Q12799 353 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.37■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 BMP8BP34820 402 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 ZFPM1Q8IX07 1006 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 GUCD1Q96NT3 240 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 MGAMO43451 1857 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 FLIIQ13045 1269 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 DNAAF4Q8WXU2 420 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 NFIAQ12857 509 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 TAF7LQ5H9L4 462 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 TEKT1Q969V4 418 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 EYSQ5T1H1 3165 aa17.33■□□□□ 0.37
CS-231ENST00000552222 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 TDHQ8IZJ6 230 aa17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 LINS1Q8NG48 757 aa17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 GADL1Q6ZQY3 521 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 SMC4Q9NTJ3 1288 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.32■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 CCDC57Q2TAC2 916 aa17.31■□□□□ 0.36
CS-231ENST00000552222 DCAF15Q66K64 600 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms