RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	SMC5	Q8IY18	1101 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TTC3-223	ENST00000492275	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		31.45	■■■□□ 2.63
TTC3-223	ENST00000492275	BTD	P43251	543 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	TEPSIN	Q96N21	525 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		31.44	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	IGSF3	O75054	1194 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	TNNI2	P48788	182 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	MOB2	Q70IA6	237 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	HAUS7	Q99871	368 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.43	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	FAM83A	Q86UY5	434 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		31.42	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	GOLIM4	O00461	696 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	NFIA	Q12857	509 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	CEP350	Q5VT06	3117 aa		31.41	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	NF2	P35240	595 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	HUNK	P57058	714 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	RHBDL3	P58872	404 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	FKBP1B	P68106	108 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	VEGFB	P49765	207 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		31.39	■■■□□ 2.62
TTC3-223	ENST00000492275	AK9	Q5TCS8	1911 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	MAP3K12	Q12852	859 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	IDI2	Q9BXS1	227 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.38	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	CYP7A1	P22680	504 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	TCP10	Q12799	353 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	PRKG1	Q13976	671 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	FAM151A	Q8WW52	585 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	GPATCH3	Q96I76	525 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		31.37	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	PPP4C	P60510	307 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		31.36	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	31.35	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		31.35	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	MYH7	P12883	1935 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	RGS3	P49796	1198 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	CAPNS2	Q96L46	248 aa		31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	MX1	P20591	662 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	RGMB	Q6NW40	437 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	LNPK	Q9C0E8	428 aa		31.33	■■■□□ 2.61
TTC3-223	ENST00000492275	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	ENTPD3	O75355	529 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	BAG3	O95817	575 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	PDE6A	P16499	860 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	NUCB1	Q02818	461 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	MAP3K11	Q16584	847 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		31.31	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	ECE1	P42892	770 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	GRM1	Q13255	1194 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	PICALM	Q13492	652 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	TEX11	Q8IYF3	940 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	STAP2	Q9UGK3	403 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		31.3	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	ERC2	O15083	957 aa		31.29	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		31.28	■■■□□ 2.6

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